Museum Wayang Kekayon adalah sebuah museum yang membahas mengenai wayang yang ada di kota Yogyakarta, museum ini tepatnya berada di Jl. Raya Yogya-Wonosari Km. 7, kurang lebih 1 km dari Ring Road Timur. Museum yang didirikan pada tahun 1990 ini memiliki koleksi berbagai wayang dan topeng serta menampilkan sejarah wayang yang diperkenalkan mulai dari abad ke-6 sampai abad ke-20. Wayang-wayang di dalam museum ini terbuat dari berbagai macam bahan baik dari kulit, kain, kayu, maupun kertas.
Sama halnya dengan museum Wayang di Jakarta, museum ini mempunyai beberapa jenis wayang, yakni seperti wayang Madya (menceritakan era pasca perang Baratayuda), wayang Purwa, wayang Beber, wayang Thengul, wayang Gedhog (cerita Dewi Candrakirana), wayang Klithik (mengisahkan Damarwulan dan Minakjinggo), wayang Suluh (mengenai sejarah perjuangan kemerdekaan Indonesia), dan masih banyak yang lainnya. Berkaitan dengan wayang Purwa, museum ini memiliki beberapa poster yang menggambarkan strategi perang yang dipakai dalam perang Baratayuda antara keluarga Pandawa dan Kurawa, yaitu: strategi strategi Gajah dan Sapit Urang.